有關媒體報導「日本與菲律賓就啟動劃定兩國專屬經濟區（EEZ）及大陸架海洋邊界談判達致共識」，漁業署表示，政府已注意到日本政府表示相關協議對第三國不具拘束力，日、菲雙方無意影響我國東部海域相關權益。不過，考量日、菲談判劃界海域與我國主張之專屬經濟海域高度重疊，我方將透過相關管道要求日、菲兩國在談判過程中應考量此一事實，不應排除或損及我國權利與利益，並與我方進行協商。

漁業署表示，我國漁民在我國主張之水域內享有正當且合法的作業權利，政府維護漁民海上作業權益與安全的立場始終堅定不變。基於「擱置爭議、共同開發」原則，我國已分別與日本及菲律賓簽署漁業相關協定，並建立常設協商機制，包括臺日漁業委員會及臺菲漁業執法合作協定技術工作小組，每年定期就漁業事務交換意見。

漁業署指出，未來將持續透過既有協商平臺，與日本及菲律賓就海事及漁業議題保持密切溝通，積極維護我國漁民作業權益與海上作業空間。

漁業署並表示，將持續與海巡署保持緊密合作，加強相關海域巡護工作，落實護漁任務，作為漁民最堅實的後盾，確保我國漁船作業安全及合法權益。